את שלוחא דרבנן הרב אריה דרעי שליט"א אין צורך להציג, פעולותיו למען יהדות ספרד יחד עם מרן הרב עובדיה יוסף זצוק"ל נחרטו באותיות של זהב על גבי ההיסטוריה של עם ישראל והיד עוד נטויה.
בשנת תשנ"ט בעקבות פעילותו הברוכה למען היהדות החרדית, החלו גורמים שונים במערכת המשפט להצר את צעדיו ולהתנכל לו, הדבר הגיע עד לתפירת תיק נגדו בו הוא כביכול הואשם בלקיחת שוחד וכו', רוב האשמות נגדו הוכחו כמופרכות אומנם דבר זה לא מנע את הכנסתו לכלא למשך שלוש שנים (מתוכם ריצה שנתיים בפועל).
כששמע כ"ק מוהרא"ש זי"ע את פרטי המקרה, הבין תיכף ומיד שכל הרדיפה היא נגד היהדות החרדית בארץ ישראל, והתגייס בכול כוחו לטובת מצוות פדיון שבויים.
לאחר שנכנס הצדיק לעומק העניין הבין שמאוחרי כל הרדיפה עומדים מספר אנשים חרדיים שעינם צרה בהצלחתו של ר' אריה, דבר זה ציער את הצדיק עד מאוד, והיה כותב מכתבים מלאי כאב, כיצד יכולים לקחת יהודי שמסר נפשו למען יהדות ספרד, ואבא לעשרה ילדים קטנים ולהכניסו למאסר על לא דבר?! לטובת העניין נפגש הצדיק עם הרב עובדיה יוסף זצ"ל והרב יצחק כדורי זצ"ל, הפגישות לוו במסירות נפש לאחר שגורמים שונים ניסו בכול כוחם למנוע את הפגישות משום ששיערו את תוצאותיהם.
במהלך כל המשפט וגם כשר' אריה היה בכלא היה הצדיק מחזק מעודד ומשמח אותו ואת בני משפחתו באמצעות מכתבים ובהם היה מוהרא"ש משתמש בביטויים נדירים על ר' אריה, הצדיק לא נח לרגע והגיע מספר פעמים לאוהל המחאה 'שאגת אריה' שהוקם מול כלא מעשיהו בו שהה ר' אריה, ואמר את האמת על אף שלא הייתה נוחה כלל לגורמים שונים, עם זאת קיים הצדיק 'לא תגורו מפני איש' במלוא מובן המילה וד"ל.
לאחר מאמצים רבים הצדיק הגיע מוהרא"ש לביקור בתאו של ר' אריה שם חיזקו במשך זמן רב, בנוסף ביקש הצדיק מאנ"ש שכל אחד יקים בחצרו סוכת מחאה עליה יתלו שלטים "לשחרר את דרעי", ואמר שהר"ת של הכרזה הזו היא שם קדוש והדברים עתיקים.
במשך כל התקופה חיזק הצדיק את הרבנית דרעי ואף הציעה לה להגיע יחד עם כל המשפחה לשהות בביתו ביבנאל עיר ברסלב על מנת לנוח מעט מהרדיפה האיומה שעברו.
סיפורו של ר' אריה דרעי העסיק את מוהרא"ש רבות ואף עלה לו בבריאות משום שהצדיק לוקח כל צרה של יהודי אל ליבו ובמקרה זה ראו זאת בחוש, ואף ניתן לראות זאת במכתבים שכתב הצדיק באותה התקופה, וכבר נדפסו בשו"ת אשר בנחל.
ברסלב סיטי מציג תמונות של הצדיק עם הרב אריה דרעי וכן בדרשות שמסר באוהל המחאה 'שאגת אריה'.